Visión: Servir de unidad de apoyo técnico al Consejo Nacional de Universidades, impulsando los procesos de transformación, dirigidos al mejoramiento de la calidad, eficiencia, eficacia y pertinencia en el Sector de Educación Superior. Garantizando la coordinación y distribución de la información inherente entre los representantes de las instituciones académicas y el Consejo Nacional de Universidades.

Misión: El Secretariado Permanente tiene como misión apoyar las actividades ordinarias del Consejo Nacional de Universidades, coordinando: las agendas de reuniones y convocando a las autoridades integrantes, las actividades de los
núcleos, comisiones permanentes y transitorias constituidas a solicitud del CNU y ofreciendo un servicio eficiente y eficaz en la elaboración de Actas y Resoluciones, con el apoyo de la tecnología informática.